4.- Ketoacyl-ACP synthase (KAS)

 

4a.- KAS I (EC 2.3.1.41)

 

Last update, nr data base: 8-16-99

Last update, dbEST data base: 8-16-99

Last update, Stanford data base: 8-18-99

 

Plant species

type of sequence

accession number

EST clone ID/

gene ID in BAC

A. thaliana

BAC

AB010698

 

A. thaliana

D c

U24177

 

A. thaliana

EST

T14190

49C11T7

A. thaliana

EST

T42406

113E5T7

A. thaliana

EST

R64830

167J7T7

A. thaliana

EST

AA586047

49C11XP

A. thaliana

EST

AA651031

167J7XP

A. thaliana

EST

AA394965

113E5XP

B. rapa

EST

AT000828

 

C. chinense

D c

AF085148

 

G. max

EST

AI440647

 

G. hirsutum

EST

AI730805

 

G. hirsutum

EST

AI726385

 

G. hirsutum

EST

AI729054

 

G. hirsutum

EST

AI728221

 

H. vulgare

D c

M60410

 

H. vulgare

G c

M95172

 

L. esculentum

EST

AI490848

 

L. esculentum

EST

AI491045

 

L. esculentum

EST

AI782633

 

O. sativa

EST

D39052

R1356_1A

O. sativa

EST

AA231816

RZ588

P. frutescens

D c

AF026148

 

R. communis

D c

L13242

 

R. communis

EST

T14995

 

Z. mays

EST

AI691355

 

Z. mays

EST

AI920551

 

Z. mays

EST

AI891223

 

Z. mays

EST

AI783379

 

Z. mays

EST

AI939825

 

 

 

4b.- KAS II (EC 2.3.1.41)

 

Last update, nr data base: 8-16-99

Last update, dbEST data base: 8-16-99

Last update, Stanford data base: 8-18-99

 

Plant species

type of sequence

accession number

EST clone ID/

gene ID in BAC

A. thaliana

BAC

AC008263

 

A. thaliana

GSS

AL093277

 

A. thaliana

GSS

B11507

 

A. thaliana

GSS

B26588

 

C. hookeriana

D c

AF060519

 

C. pulcherrima

D c

AF060518

 

C. wrightii

D c

U67317

 

C. wrightii

D c

U67316

 

G. max

EST

AI496152

 

H. vulgare

D c

Z34269

 

H. vulgare

D c

Z34268

 

H. vulgare

D p

Z34266

putative

H. vulgare

D p

Z34267

putative

L. esculentum

EST

AI899491

 

L. esculentum

EST

AI773210

 

M. polymorpha

EST

C96246

 

M. polymorpha

EST

C95735

 

O. sativa

EST

AU031593

E61922_1A

O. sativa

EST

AU031594

E61922_2Z

O. sativa

EST

AU069780

 

P. frutescens

D c

AF026149

 

R. communis

D c

L13241

 

Z. mays

EST

AI738377

 

Z. mays

EST

AI691899

 

Z. mays

EST

AI944099

 

Z. mays

EST

AI770923

 

 

 

4c.- KAS III (EC 2.3.1.41)

 

Last update, nr data base: 8-16-99

Last update, dbEST data base: 8-16-99

Last update, Stanford data base: 8-16-99

 

Plant species

type of sequence

accession number

EST clone ID/

gene ID in BAC

A. porrum

D c

U30600

 

A. thaliana

D c

L31891

 

A. thaliana

G c

Y11689

 

A. thaliana

BAC

AC007190

 

A. thaliana

BAC

AC005698

T3P18.20

A. thaliana

G p

X99111

 

C. wrightii

D c

U15934

 

C. wrightii

D c

U15935

 

E. oleifera

D c

AF169015

 

E. guineensis

D c

AF143502

 

O. sativa

EST

AA751713

96AS0490

P. frutescens

D c

AF026150

 

P. frutescens

D c

AF026151

 

S. oleracea

D c

Z22771

 

Z. mays

EST

AI438573

 

 

algae (encoded in the chloroplast genome):

Algae species

type of sequence

accession number

EST clone ID/

gene ID in BAC

P. purpurea

G(chl) c

U38804

 

P. purpurea

G(chl) c

Z14034

 

 

 

4d.- Putative mitochondrial KAS II

 

Multiple alignment of the N-terminal sequence and sequence of the active center with various KASes

 

Multiple alignment of full length plant KAS I and KAS II sequences with those from fungi and bacteria

 

Plant species

type of

sequence

accession

number

EST clone ID/gene ID in BAC

A. thaliana

BAC

AC006951-1

gene T1O3.5

A. thaliana

GSS

AL094369

BAC (T13B11), might be a contamination

A. thaliana

GSS

AL094368

SP6 end of the same BAC (T13B11)