23.- Long-chain acyl-CoA synthetase. (EC 6.2.1.3)

 

Multiple alignment of Arabidopsis ESTs

 

Multiple alignment of rice ESTs

 

Multiple alignment of Arabidopsis and Brassica full length sequences

 

Last update, nr data base: 8-20-99

Last update, dbEST data base: 8-20-99

Last update, Stanford data base: 8-20-99

 

Plant species

type of

sequence

Accession

number

EST clone ID/

gene ID in BAC

A. thaliana

BAC

AL078468

 

A. thaliana

BAC

AC002337

At gene T08I13.8

A. thaliana

BAC

AF080118

At gene F8M12.15

A. thaliana

BAC

AC006951

At gene T1O3.24

A. thaliana

BAC

AC007504

 

A. thaliana

BAC

AC007478

 

A. thaliana

BAC

AC007213

T23O15.3=T1O3.24

A. thaliana

BAC

AB012247

 

A. thaliana

BAC p

AL049525

gene F25I24.240

A. thaliana

BAC

AL049876

gene T22B4.10

A. thaliana

GSS

B98180

 

A. thaliana

GSS

AL089852

 

A. thaliana

GSS

B10723

 

A. thaliana

GSS

AL084848

 

A. thaliana

GSS

AL096623

 

A. thaliana

GSS

B25198

 

A. thaliana

GSS

B27773

 

A. thaliana

GSS

B61512

 

A. thaliana

EST

N65639

240K22T7

A. thaliana

EST

T20845

94H17T7

A. thaliana

EST

T45466

131M3T7

A. thaliana

EST

N38362

214H9T7

A. thaliana

EST

AA395246

119E14XP

A. thaliana

EST

T43231

119E14T7

A. thaliana

EST

N65171

229E14T7

A. thaliana

EST

H77181

204K9T7

A. thaliana

EST

H76835

204D10T7

A. thaliana

EST

H76796

203J11T7

A. thaliana

EST

Z26001

GBGe115a

A. thaliana

EST

AA597813

244N14T7

A. thaliana

EST

T13791

41A4T7

A. thaliana

EST

N96183

G10C8T7

A. thaliana

EST

N96049

F9A9T7

B. napus

D c

X94624

 

B. napus

D c

Z72153

 

B. napus

EST

H74875

 

B. rapa

EST

AT000851

 

B. rapa

EST

L38543

 

B. rapa

EST

AT000434

 

C. arietinum

D p

AJ006025

 

C. unshiu

EST

C95532

 

G. max

EST

AI442523

 

G. max

EST

AI495829

 

G. max

EST

AI442373

 

G. hirsutum

EST

AI731650

 

G. hirsutum

EST

AI728032

 

G. hirsutum

EST

AI725479

 

L. esculentum

EST

AI778471

 

L. esculentum

EST

AI896364

 

L. esculentum

EST

AI777927

 

L. esculentum

EST

AI775677

 

L. esculentum

EST

AI781636

 

O. sativa

GSS

AQ259882

 

O. sativa

GSS

AQ258999

 

O. sativa

EST

AU030119

E50648_2Z

O. sativa

EST

D24049

R1012_1A

O. sativa

EST

AU031730

R1012_8Z

O. sativa

EST

C25972

C11296_1A

O. sativa

EST

C22556

E20342_2A

O. sativa

EST

C22557

E20342_3Z

O. sativa

EST

C26635

C12739_1A

O. sativa

EST

D48566

S14859_2A

O. sativa

EST

C26372

C12207_1A

O. sativa

EST

C99732

E21185_1A

O. sativa

EST

C99733

E21185_4Z

O. sativa

EST

D24592

 

O. sativa

EST

C91816

E31624_3A

O. sativa

EST

D23937

 

O. sativa

EST

C19507

E10527_1A

O. sativa

EST

D46145

 

O. sativa

EST

D48526

 

P. patens

EST

AJ225512

 

Z. mays

EST

AA030723

 

Z. mays

EST

AI795367

 

Z. mays

EST

AI941750

 

Z. mays

EST

AI783411

 

Z. mays

EST

AI714774

 

Z. mays

EST

AI622673

 

Z. mays

EST

AI932129

 

Z. mays

EST

AI622672

 

Z. mays

EST

AI920732

 

Z. mays

EST

AA979750

 

Z. mays

EST

AI438903

 

 

 

  Putative AMP-binding proteins

High similarity to LCFACSes;  no activity detected.

 

Plant species

type of

 sequence

Accession

number

EST clone ID/gene ID

in BAC

A. thaliana

BAC

AC004260

gene T14N5.10

A. thaliana

BAC

AF024504

gene A_TM017A05.12

A. thaliana

BAC

AB005242-1

 

A. thaliana

BAC

AB005242-2

 

A. thaliana

BAC

AB026636

 

A. thaliana

BAC

Z97335

 

A. thaliana

BAC

AC007509

 

A. thaliana

BAC

AC007396

 

A. thaliana

GSS

B23048

 

A. thaliana

GSS

AL086850

 

A. thaliana

GSS

AL088931

 

A. thaliana

GSS

B24772

 

A. thaliana

GSS

B61655

 

A. thaliana

GSS

AL091426

 

A. thaliana

EST

H76931

205M6T7

A. thaliana

EST

H76865

204L16T7

A. thaliana

EST

T44244

123N12T7

A. thaliana

EST

T20754

92G15T7

A. thaliana

EST

AA586273

92G15XP

A. thaliana

EST

Z37655

VBVHF05 5’

A. thaliana

EST

Z37656

VBVHF05 3'

A. thaliana

EST

H76181

196I16T7

A. thaliana

EST

T22607

99N9T7

A. thaliana

EST

AA395705

99N9XP

A. thaliana

EST

AA389838

 

A. thaliana

EST

Z25500

GBGe60

A. thaliana

EST

Z26118

GBGe60

A. thaliana

EST

T21926

104H9T7

A. thaliana

EST

AI100102

104H9XP

B. napus

D c

Z72152

 

B. napus

D c

Z72151

 

B. napus

D c

X94625

 

C. lanatus

EST

AA660131

 

C. lanatus

EST

AI563109

 

C. lanatus

EST

AA660149

 

G. max

EST

AI416886

 

G. max

EST

AI441007

 

G. max

EST

AI440632

 

G. max

EST

AI522971

 

G. hirsutum

EST

AA659974

 

G. hirsutum

EST

AI730172

 

L. esculentum

EST

AI781862

 

L. esculentum

EST

AI489639

 

L. esculentum

EST

AI490004

 

L. esculentum

EST

AI488710

 

L. esculentum

EST

AI894610

 

L. esculentum

EST

AI487709

 

M. crystallinum

EST

AA866560

 

O. sativa

EST

D39204

R3023_1A

O. sativa

EST

AU031982

R3023_6Z

O. sativa

EST

AA754309

97MJ0214

O. sativa

EST

D47117

 

O. sativa

EST

C28941

C62903_1A

O. sativa

EST

C25936

C11231_2A

O. sativa

EST

C26312

C12077_1A

O. sativa

EST

D22107

C10349_1A

O. sativa

EST

C26372

C12207_1A

O. sativa

EST

D22971

C1896_1A

Z. mays

EST

AI619279